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Manuel de prélèvement en gastro-entérologie

Biopsies digestives, polypes, recherche infectieuse

Ce manuel a pour objectif d'assurer la qualité des prélèvements réalisés pour le diagnostic et le suivi des pathologies du tube digestif.

Principes clés

  • Prélever la lésion ou la zone anormale.
  • Utiliser un matériel propre et adapté.
  • Respecter l'asepsie et éviter la contamination.
  • Identifier immédiatement le prélèvement.
  • Acheminer rapidement au laboratoire.

1Avant le prélèvement

  • Vérifier l'indication, le contexte clinique et le type de prélèvement prévu.
  • Informer le patient et obtenir son consentement.
  • Vérifier les traitements en cours (notamment AINS, anticoagulants) et les contre-indications.
  • Préparer le matériel nécessaire.

Types de prélèvements et matériel

Biopsies (endoscopie haute et basse)Pince à biopsie à usage uniquePot stérile à bouchon vissé (formol 10 % tamponné, soit formaldéhyde 4 %)
Exérèses polypoïdesAnse à polypectomie ou pince adaptéePot stérile (formol 10 % tamponné)
Cytologie (brossage, lavage)Brosse cytologique ou dispositif de lavageMilieu de conservation dédié (Cytolyt® ou équivalent)
Prélèvements microbiologiquesÉcouvillon stérile ou pot stérile sans additifMilieu de transport si indiqué

Étiqueter au lit du patient : nom, prénom, date de naissance, date/heure du prélèvement, site, nature du prélèvement et prescripteur.

2Pendant le prélèvement

  • Repérer précisément la lésion ou la zone anormale.
  • Réaliser plusieurs biopsies représentatives (≥ 4 si possible).
  • Pour les lésions étendues : prélever à distance des berges ulcérées ou nécrotiques.
  • Éviter les contaminations (salive, flore cutanée, selles, antiseptiques).
  • Placer immédiatement le prélèvement dans le contenant adapté.

Spécificités par type de prélèvement

Œsophage – Estomac – Duodénum

Gastrite et recherche d'H. pylori (protocole de Sydney) : 5 biopsies, 2 dans l'antre, 1 à l'angulus, 2 dans le corps, antre et corps en pots séparés. Lésion focale : ≥ 4 fragments sur la lésion, en évitant les zones nécrotiques.

Iléon – Côlon

Biopsies : ≥ 4 fragments par segment atteint. Prélèvements séparés par site (iléo-cæcal, côlon droit, transverse, gauche, rectum). Suspicion de MICI : biopsies étagées, y compris en muqueuse d'aspect normal.

Polypes

Exérèse complète si possible. Ne pas fragmenter le polype. Fixer en entier. Pour les pièces de mucosectomie ou de dissection sous-muqueuse : épingler à plat sur support avant fixation.

Recherche infectieuse

Prélèvements avant tout traitement antibiotique. Prélever les selles en quantité suffisante (≥ 5 g). Conserver au frais (2–8 °C) si délai > 2 h.

3Après le prélèvement

  • Vérifier l'identification du prélèvement et sa concordance avec la demande.
  • Assurer une conservation adaptée : formol 10 % tamponné pour anatomopathologie, milieu de transport approprié pour cytologie ou microbiologie, au frais (2–8 °C) pour microbiologie.
  • Remplir la fiche de demande d'examen (renseignements cliniques, traitement, localisation, aspect endoscopique).
  • Acheminer rapidement au laboratoire : anatomopathologie < 24 h, microbiologie < 2 h (< 24 h au frais), cytologie selon délai du milieu utilisé.

Délais d'acheminement recommandés

Anatomopathologie (formol)< 24 h à température ambiante
Microbiologie (selles)< 2 h au labo (≤ 24 h au frais)
Cytologie (milieu dédié)selon notice du fabricant

Erreurs à éviter

  • Prélèvement insuffisant ou non représentatif
  • Contamination ou mauvaise asepsie
  • Fixateur inadapté ou volume insuffisant
  • Mauvaise identification
  • Délai d'acheminement prolongé
Manuel de prélèvement VesunaPath ; recommandations SFP / SNFGEMise à jour : 09/2026